Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFHP08603 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFHP08603 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHP08603 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHP08603 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHP08603 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHP08603 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHP08603 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHP08603 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHP08603 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHP08603 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHP08603 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFHP08603 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHP08603 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHP08603 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHP08603 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHP08603 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHP08603 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHP08603 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHP08603 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFHP08603 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFHP08603 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFHP08603 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFHP08603 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFHP08603 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFHP08603 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFHP08603 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFHP08603 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFHP08603 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFHP08603 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFHP08603 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFHP08603 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFHP08603 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFHP08603 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFHP08603 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFHP08603 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFHP08603 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFHP08603 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFHP08603 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFHP08603 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHP08603 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHP08603 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHP08603 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHP08603 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHP08603 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHP08603 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CFHP08603 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFHP08603 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFHP08603 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFHP08603 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHP08603 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHP08603 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHP08603 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHP08603 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHP08603 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHP08603 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHP08603 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHP08603 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFHP08603 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFHP08603 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFHP08603 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFHP08603 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFHP08603 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFHP08603 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFHP08603 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFHP08603 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFHP08603 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFHP08603 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHP08603 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms