Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NGFRP08138 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NGFRP08138 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NGFRP08138 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NGFRP08138 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NGFRP08138 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NGFRP08138 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NGFRP08138 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NGFRP08138 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NGFRP08138 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NGFRP08138 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NGFRP08138 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NGFRP08138 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NGFRP08138 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NGFRP08138 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NGFRP08138 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NGFRP08138 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NGFRP08138 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NGFRP08138 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NGFRP08138 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NGFRP08138 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NGFRP08138 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NGFRP08138 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NGFRP08138 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NGFRP08138 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NGFRP08138 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NGFRP08138 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NGFRP08138 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NGFRP08138 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NGFRP08138 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NGFRP08138 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NGFRP08138 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NGFRP08138 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NGFRP08138 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NGFRP08138 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NGFRP08138 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NGFRP08138 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NGFRP08138 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NGFRP08138 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NGFRP08138 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NGFRP08138 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NGFRP08138 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NGFRP08138 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NGFRP08138 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NGFRP08138 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NGFRP08138 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NGFRP08138 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NGFRP08138 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NGFRP08138 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NGFRP08138 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NGFRP08138 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NGFRP08138 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NGFRP08138 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NGFRP08138 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NGFRP08138 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NGFRP08138 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NGFRP08138 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NGFRP08138 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NGFRP08138 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NGFRP08138 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NGFRP08138 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NGFRP08138 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NGFRP08138 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NGFRP08138 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NGFRP08138 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NGFRP08138 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NGFRP08138 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NGFRP08138 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NGFRP08138 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NGFRP08138 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NGFRP08138 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NGFRP08138 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NGFRP08138 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NGFRP08138 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms