Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYNP07948 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYNP07948 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYNP07948 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYNP07948 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYNP07948 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYNP07948 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYNP07948 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYNP07948 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYNP07948 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYNP07948 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYNP07948 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNP07948 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNP07948 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNP07948 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNP07948 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNP07948 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNP07948 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LYNP07948 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LYNP07948 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LYNP07948 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LYNP07948 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYNP07948 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LYNP07948 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYNP07948 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYNP07948 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYNP07948 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYNP07948 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYNP07948 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LYNP07948 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LYNP07948 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNP07948 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNP07948 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNP07948 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNP07948 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNP07948 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYNP07948 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYNP07948 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYNP07948 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYNP07948 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYNP07948 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNP07948 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNP07948 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNP07948 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNP07948 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNP07948 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNP07948 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNP07948 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNP07948 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNP07948 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYNP07948 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYNP07948 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYNP07948 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYNP07948 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYNP07948 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYNP07948 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYNP07948 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LYNP07948 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYNP07948 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LYNP07948 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LYNP07948 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYNP07948 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYNP07948 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYNP07948 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYNP07948 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYNP07948 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYNP07948 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LYNP07948 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYNP07948 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms