Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSBP07858 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSBP07858 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSBP07858 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSBP07858 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSBP07858 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSBP07858 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSBP07858 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSBP07858 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSBP07858 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSBP07858 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSBP07858 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSBP07858 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSBP07858 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSBP07858 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSBP07858 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSBP07858 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSBP07858 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSBP07858 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSBP07858 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSBP07858 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSBP07858 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSBP07858 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSBP07858 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSBP07858 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSBP07858 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSBP07858 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSBP07858 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSBP07858 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSBP07858 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSBP07858 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSBP07858 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSBP07858 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSBP07858 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSBP07858 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSBP07858 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSBP07858 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSBP07858 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSBP07858 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSBP07858 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSBP07858 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSBP07858 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSBP07858 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSBP07858 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSBP07858 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSBP07858 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSBP07858 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSBP07858 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSBP07858 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSBP07858 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSBP07858 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSBP07858 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSBP07858 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSBP07858 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSBP07858 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSBP07858 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSBP07858 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSBP07858 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSBP07858 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSBP07858 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSBP07858 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSBP07858 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSBP07858 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSBP07858 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSBP07858 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSBP07858 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSBP07858 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSBP07858 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSBP07858 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSBP07858 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSBP07858 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSBP07858 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSBP07858 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSBP07858 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms