Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSN3P07498 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CSN3P07498 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSN3P07498 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSN3P07498 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSN3P07498 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSN3P07498 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSN3P07498 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSN3P07498 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSN3P07498 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSN3P07498 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSN3P07498 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSN3P07498 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN3P07498 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN3P07498 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN3P07498 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN3P07498 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms