Protein–RNA interactions for Protein: P07478

PRSS2, Trypsin-2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS2P07478 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRSS2P07478 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRSS2P07478 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms