Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKMP06732 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKMP06732 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKMP06732 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKMP06732 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMP06732 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMP06732 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMP06732 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMP06732 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMP06732 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMP06732 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKMP06732 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKMP06732 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKMP06732 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKMP06732 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMP06732 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMP06732 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMP06732 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMP06732 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKMP06732 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKMP06732 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKMP06732 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKMP06732 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKMP06732 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKMP06732 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CKMP06732 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMP06732 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMP06732 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMP06732 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKMP06732 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMP06732 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMP06732 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMP06732 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMP06732 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMP06732 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMP06732 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMP06732 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMP06732 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMP06732 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKMP06732 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKMP06732 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKMP06732 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKMP06732 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKMP06732 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKMP06732 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMP06732 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMP06732 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMP06732 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMP06732 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMP06732 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMP06732 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKMP06732 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMP06732 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMP06732 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMP06732 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMP06732 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMP06732 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMP06732 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKMP06732 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKMP06732 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKMP06732 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKMP06732 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKMP06732 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKMP06732 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CKMP06732 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKMP06732 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms