Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2AP05549 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TFAP2AP05549 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFAP2AP05549 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms