Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDLRP01130 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDLRP01130 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDLRP01130 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDLRP01130 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRP01130 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRP01130 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRP01130 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRP01130 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRP01130 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRP01130 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRP01130 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDLRP01130 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRP01130 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRP01130 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRP01130 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRP01130 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRP01130 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRP01130 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRP01130 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRP01130 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRP01130 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDLRP01130 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRP01130 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRP01130 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRP01130 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRP01130 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRP01130 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRP01130 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRP01130 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRP01130 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDLRP01130 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDLRP01130 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRP01130 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRP01130 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRP01130 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRP01130 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRP01130 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRP01130 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRP01130 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRP01130 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDLRP01130 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRP01130 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRP01130 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRP01130 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRP01130 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRP01130 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRP01130 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDLRP01130 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDLRP01130 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDLRP01130 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDLRP01130 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRP01130 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRP01130 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRP01130 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRP01130 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRP01130 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRP01130 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRP01130 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDLRP01130 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDLRP01130 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRP01130 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRP01130 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRP01130 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRP01130 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRP01130 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRP01130 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRP01130 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRP01130 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDLRP01130 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms