Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPP00450 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPP00450 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPP00450 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPP00450 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPP00450 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPP00450 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPP00450 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CPP00450 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPP00450 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPP00450 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPP00450 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPP00450 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPP00450 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPP00450 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPP00450 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPP00450 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPP00450 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPP00450 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPP00450 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPP00450 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPP00450 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPP00450 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPP00450 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPP00450 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPP00450 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPP00450 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPP00450 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPP00450 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPP00450 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPP00450 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPP00450 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPP00450 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPP00450 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPP00450 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPP00450 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPP00450 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPP00450 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPP00450 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPP00450 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPP00450 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPP00450 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPP00450 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPP00450 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPP00450 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPP00450 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPP00450 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPP00450 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPP00450 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPP00450 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPP00450 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPP00450 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPP00450 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPP00450 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPP00450 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPP00450 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPP00450 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CPP00450 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPP00450 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPP00450 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPP00450 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPP00450 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPP00450 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPP00450 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPP00450 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPP00450 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPP00450 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPP00450 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPP00450 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPP00450 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPP00450 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPP00450 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPP00450 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPP00450 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPP00450 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPP00450 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPP00450 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPP00450 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPP00450 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPP00450 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CPP00450 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPP00450 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPP00450 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPP00450 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPP00450 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPP00450 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms