Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLIC3O95833 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLIC3O95833 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLIC3O95833 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms