Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSL3O95573 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSL3O95573 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSL3O95573 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms