Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGDSO95455 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGDSO95455 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGDSO95455 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGDSO95455 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGDSO95455 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGDSO95455 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TGDSO95455 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGDSO95455 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGDSO95455 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGDSO95455 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGDSO95455 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGDSO95455 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGDSO95455 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGDSO95455 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGDSO95455 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGDSO95455 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGDSO95455 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGDSO95455 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGDSO95455 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TGDSO95455 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGDSO95455 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGDSO95455 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGDSO95455 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TGDSO95455 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGDSO95455 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGDSO95455 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGDSO95455 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGDSO95455 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGDSO95455 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGDSO95455 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGDSO95455 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGDSO95455 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGDSO95455 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGDSO95455 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGDSO95455 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGDSO95455 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGDSO95455 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGDSO95455 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGDSO95455 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGDSO95455 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGDSO95455 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGDSO95455 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGDSO95455 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGDSO95455 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGDSO95455 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGDSO95455 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGDSO95455 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGDSO95455 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGDSO95455 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGDSO95455 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGDSO95455 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGDSO95455 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGDSO95455 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGDSO95455 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGDSO95455 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGDSO95455 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGDSO95455 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGDSO95455 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGDSO95455 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGDSO95455 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGDSO95455 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGDSO95455 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGDSO95455 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGDSO95455 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGDSO95455 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TGDSO95455 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGDSO95455 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGDSO95455 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGDSO95455 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGDSO95455 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGDSO95455 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGDSO95455 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGDSO95455 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGDSO95455 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms