Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC31AO94979 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC31AO94979 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms