Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALDH1A2O94788 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A2O94788 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms