Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP72O76094 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP72O76094 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP72O76094 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP72O76094 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP72O76094 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP72O76094 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP72O76094 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP72O76094 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP72O76094 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRP72O76094 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRP72O76094 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP72O76094 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP72O76094 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP72O76094 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRP72O76094 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP72O76094 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP72O76094 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRP72O76094 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRP72O76094 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP72O76094 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP72O76094 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP72O76094 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP72O76094 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP72O76094 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP72O76094 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP72O76094 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP72O76094 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP72O76094 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRP72O76094 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP72O76094 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP72O76094 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP72O76094 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP72O76094 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP72O76094 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP72O76094 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP72O76094 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRP72O76094 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP72O76094 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP72O76094 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP72O76094 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP72O76094 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP72O76094 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP72O76094 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP72O76094 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP72O76094 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRP72O76094 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRP72O76094 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRP72O76094 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRP72O76094 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP72O76094 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP72O76094 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP72O76094 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP72O76094 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP72O76094 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRP72O76094 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRP72O76094 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP72O76094 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP72O76094 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP72O76094 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP72O76094 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP72O76094 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP72O76094 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP72O76094 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP72O76094 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRP72O76094 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP72O76094 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRP72O76094 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms