Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFPL3O75679 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL3O75679 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL3O75679 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms