Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SKAP2O75563 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKAP2O75563 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKAP2O75563 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms