Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX3O75364 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX3O75364 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX3O75364 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PITX3O75364 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX3O75364 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX3O75364 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX3O75364 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX3O75364 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX3O75364 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX3O75364 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX3O75364 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX3O75364 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX3O75364 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX3O75364 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX3O75364 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX3O75364 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX3O75364 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX3O75364 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX3O75364 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX3O75364 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX3O75364 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX3O75364 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX3O75364 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX3O75364 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX3O75364 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX3O75364 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX3O75364 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PITX3O75364 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PITX3O75364 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PITX3O75364 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX3O75364 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX3O75364 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX3O75364 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX3O75364 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX3O75364 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PITX3O75364 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX3O75364 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX3O75364 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX3O75364 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX3O75364 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX3O75364 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX3O75364 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PITX3O75364 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX3O75364 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITX3O75364 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX3O75364 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX3O75364 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX3O75364 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX3O75364 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX3O75364 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX3O75364 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX3O75364 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX3O75364 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITX3O75364 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITX3O75364 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITX3O75364 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX3O75364 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX3O75364 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX3O75364 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX3O75364 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX3O75364 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITX3O75364 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms