Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIA2O75334 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPFIA2O75334 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms