Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM20BO75063 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM20BO75063 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20BO75063 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms