Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSVO60911 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSVO60911 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSVO60911 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSVO60911 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSVO60911 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSVO60911 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSVO60911 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSVO60911 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSVO60911 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSVO60911 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSVO60911 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSVO60911 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSVO60911 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSVO60911 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSVO60911 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSVO60911 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSVO60911 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTSVO60911 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSVO60911 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSVO60911 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSVO60911 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSVO60911 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSVO60911 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSVO60911 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSVO60911 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSVO60911 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSVO60911 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSVO60911 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSVO60911 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSVO60911 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSVO60911 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSVO60911 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSVO60911 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSVO60911 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSVO60911 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSVO60911 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSVO60911 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSVO60911 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSVO60911 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSVO60911 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSVO60911 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSVO60911 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSVO60911 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSVO60911 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSVO60911 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSVO60911 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSVO60911 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSVO60911 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSVO60911 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSVO60911 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSVO60911 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSVO60911 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSVO60911 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSVO60911 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSVO60911 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSVO60911 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSVO60911 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms