Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX2O60749 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX2O60749 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX2O60749 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX2O60749 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX2O60749 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX2O60749 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX2O60749 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX2O60749 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX2O60749 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX2O60749 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX2O60749 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX2O60749 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX2O60749 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX2O60749 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX2O60749 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX2O60749 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX2O60749 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX2O60749 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX2O60749 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX2O60749 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX2O60749 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX2O60749 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX2O60749 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX2O60749 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX2O60749 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX2O60749 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX2O60749 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX2O60749 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX2O60749 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX2O60749 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX2O60749 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX2O60749 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX2O60749 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX2O60749 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX2O60749 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX2O60749 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX2O60749 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX2O60749 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX2O60749 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX2O60749 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX2O60749 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX2O60749 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX2O60749 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX2O60749 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX2O60749 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX2O60749 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX2O60749 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX2O60749 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX2O60749 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX2O60749 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX2O60749 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX2O60749 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX2O60749 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX2O60749 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX2O60749 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX2O60749 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX2O60749 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX2O60749 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms