Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN3O60664 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLIN3O60664 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLIN3O60664 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms