Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSL4O60488 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSL4O60488 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSL4O60488 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSL4O60488 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms