Protein–RNA interactions for Protein: O60353

FZD6, Frizzled-6, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD6O60353 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD6O60353 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD6O60353 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD6O60353 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD6O60353 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD6O60353 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD6O60353 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD6O60353 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FZD6O60353 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FZD6O60353 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD6O60353 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD6O60353 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD6O60353 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD6O60353 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FZD6O60353 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD6O60353 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD6O60353 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD6O60353 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FZD6O60353 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD6O60353 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD6O60353 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD6O60353 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD6O60353 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD6O60353 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD6O60353 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FZD6O60353 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD6O60353 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD6O60353 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FZD6O60353 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD6O60353 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD6O60353 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD6O60353 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD6O60353 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD6O60353 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FZD6O60353 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FZD6O60353 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD6O60353 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD6O60353 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD6O60353 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD6O60353 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FZD6O60353 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FZD6O60353 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FZD6O60353 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD6O60353 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD6O60353 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD6O60353 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD6O60353 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD6O60353 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD6O60353 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FZD6O60353 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD6O60353 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD6O60353 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD6O60353 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD6O60353 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD6O60353 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FZD6O60353 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD6O60353 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD6O60353 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD6O60353 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD6O60353 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD6O60353 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD6O60353 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FZD6O60353 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD6O60353 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD6O60353 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD6O60353 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD6O60353 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD6O60353 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD6O60353 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FZD6O60353 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD6O60353 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD6O60353 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FZD6O60353 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD6O60353 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD6O60353 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD6O60353 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD6O60353 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD6O60353 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD6O60353 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD6O60353 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD6O60353 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD6O60353 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FZD6O60353 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD6O60353 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD6O60353 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD6O60353 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD6O60353 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD6O60353 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD6O60353 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FZD6O60353 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD6O60353 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD6O60353 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FZD6O60353 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD6O60353 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD6O60353 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD6O60353 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD6O60353 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD6O60353 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD6O60353 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FZD6O60353 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms