Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
KIAA0556O60303 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KIAA0556O60303 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
KIAA0556O60303 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
KIAA0556O60303 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KIAA0556O60303 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms