Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LANCL1O43813 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LANCL1O43813 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms