Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYNGR2O43760 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYNGR2O43760 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms