Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHMP2AO43633 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP2AO43633 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP2AO43633 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms