Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLF4O43474 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF4O43474 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF4O43474 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF4O43474 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF4O43474 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF4O43474 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF4O43474 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF4O43474 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF4O43474 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF4O43474 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF4O43474 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF4O43474 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF4O43474 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF4O43474 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF4O43474 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF4O43474 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF4O43474 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF4O43474 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF4O43474 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF4O43474 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF4O43474 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF4O43474 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF4O43474 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF4O43474 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF4O43474 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF4O43474 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF4O43474 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF4O43474 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF4O43474 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF4O43474 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF4O43474 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF4O43474 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF4O43474 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF4O43474 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF4O43474 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF4O43474 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF4O43474 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF4O43474 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF4O43474 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF4O43474 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF4O43474 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF4O43474 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF4O43474 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF4O43474 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF4O43474 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF4O43474 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF4O43474 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF4O43474 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF4O43474 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF4O43474 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF4O43474 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF4O43474 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF4O43474 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF4O43474 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF4O43474 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF4O43474 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF4O43474 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF4O43474 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF4O43474 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF4O43474 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF4O43474 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF4O43474 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms