Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTIFO43310 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTIFO43310 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTIFO43310 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTIFO43310 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTIFO43310 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTIFO43310 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTIFO43310 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTIFO43310 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTIFO43310 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTIFO43310 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTIFO43310 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTIFO43310 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTIFO43310 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTIFO43310 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTIFO43310 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTIFO43310 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTIFO43310 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTIFO43310 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTIFO43310 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTIFO43310 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTIFO43310 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTIFO43310 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTIFO43310 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTIFO43310 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTIFO43310 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTIFO43310 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTIFO43310 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTIFO43310 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTIFO43310 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTIFO43310 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTIFO43310 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTIFO43310 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTIFO43310 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTIFO43310 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTIFO43310 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTIFO43310 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTIFO43310 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTIFO43310 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTIFO43310 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTIFO43310 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTIFO43310 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTIFO43310 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTIFO43310 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTIFO43310 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTIFO43310 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTIFO43310 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTIFO43310 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTIFO43310 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTIFO43310 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTIFO43310 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTIFO43310 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTIFO43310 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTIFO43310 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTIFO43310 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTIFO43310 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTIFO43310 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTIFO43310 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTIFO43310 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTIFO43310 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTIFO43310 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTIFO43310 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTIFO43310 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTIFO43310 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTIFO43310 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTIFO43310 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTIFO43310 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTIFO43310 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTIFO43310 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTIFO43310 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTIFO43310 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTIFO43310 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTIFO43310 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTIFO43310 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTIFO43310 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTIFO43310 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTIFO43310 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTIFO43310 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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