Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC7A4O43246 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC7A4O43246 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms