Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRXO43186 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRXO43186 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRXO43186 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRXO43186 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRXO43186 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRXO43186 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRXO43186 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRXO43186 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRXO43186 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRXO43186 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRXO43186 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRXO43186 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CRXO43186 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRXO43186 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRXO43186 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRXO43186 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRXO43186 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRXO43186 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRXO43186 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRXO43186 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRXO43186 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRXO43186 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRXO43186 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRXO43186 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRXO43186 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRXO43186 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRXO43186 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRXO43186 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRXO43186 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRXO43186 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRXO43186 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRXO43186 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRXO43186 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRXO43186 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRXO43186 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRXO43186 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRXO43186 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRXO43186 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRXO43186 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRXO43186 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRXO43186 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRXO43186 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRXO43186 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRXO43186 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRXO43186 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRXO43186 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRXO43186 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRXO43186 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CRXO43186 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRXO43186 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRXO43186 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRXO43186 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRXO43186 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRXO43186 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRXO43186 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRXO43186 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRXO43186 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRXO43186 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRXO43186 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRXO43186 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRXO43186 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRXO43186 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRXO43186 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRXO43186 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRXO43186 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms