Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLGNO14967 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLGNO14967 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLGNO14967 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLGNO14967 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLGNO14967 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLGNO14967 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLGNO14967 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLGNO14967 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLGNO14967 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLGNO14967 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLGNO14967 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLGNO14967 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLGNO14967 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLGNO14967 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLGNO14967 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLGNO14967 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLGNO14967 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLGNO14967 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLGNO14967 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLGNO14967 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLGNO14967 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLGNO14967 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLGNO14967 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLGNO14967 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLGNO14967 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLGNO14967 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLGNO14967 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLGNO14967 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLGNO14967 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLGNO14967 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLGNO14967 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLGNO14967 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLGNO14967 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLGNO14967 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLGNO14967 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLGNO14967 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLGNO14967 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLGNO14967 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLGNO14967 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLGNO14967 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLGNO14967 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLGNO14967 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLGNO14967 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLGNO14967 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLGNO14967 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLGNO14967 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLGNO14967 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLGNO14967 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLGNO14967 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLGNO14967 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CLGNO14967 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLGNO14967 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLGNO14967 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLGNO14967 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLGNO14967 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLGNO14967 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLGNO14967 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLGNO14967 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLGNO14967 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLGNO14967 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLGNO14967 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLGNO14967 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLGNO14967 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLGNO14967 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLGNO14967 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLGNO14967 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLGNO14967 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLGNO14967 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLGNO14967 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLGNO14967 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLGNO14967 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLGNO14967 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLGNO14967 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLGNO14967 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLGNO14967 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLGNO14967 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLGNO14967 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLGNO14967 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLGNO14967 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLGNO14967 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLGNO14967 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLGNO14967 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLGNO14967 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLGNO14967 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLGNO14967 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLGNO14967 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLGNO14967 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLGNO14967 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLGNO14967 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms