Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBFD1O14562 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBFD1O14562 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBFD1O14562 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms