Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBE2CO00762 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms