Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRIT1O00522 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRIT1O00522 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms