Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB6E9PJ23 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms