Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM1B2RUZ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM1B2RUZ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms