Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COLCA2A8K830 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COLCA2A8K830 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms