Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM200CA6NKL6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM200CA6NKL6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM200CA6NKL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms