Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23AA6NH52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23AA6NH52 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms