Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IRGMA1A4Y4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IRGMA1A4Y4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRGMA1A4Y4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms