Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM72A0PK05 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM72A0PK05 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM72A0PK05 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM72A0PK05 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM72A0PK05 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM72A0PK05 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM72A0PK05 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM72A0PK05 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM72A0PK05 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms