Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC26A0AVF1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC26A0AVF1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC26A0AVF1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms