Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXV3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXV3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms