Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0J9YVX5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0J9YVX5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0J9YVX5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms