Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
V9GYY9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
V9GYY9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
V9GYY9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
V9GYY9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYY9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYY9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
V9GYY9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYY9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
V9GYY9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYY9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
V9GYY9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V9GYY9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V9GYY9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYY9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V9GYY9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
V9GYY9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
V9GYY9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
V9GYY9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V9GYY9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V9GYY9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYY9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYY9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
V9GYY9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
V9GYY9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
V9GYY9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
V9GYY9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
V9GYY9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
V9GYY9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
V9GYY9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYY9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
V9GYY9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYY9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
V9GYY9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYY9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
V9GYY9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
V9GYY9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
V9GYY9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
V9GYY9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYY9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
V9GYY9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYY9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYY9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
V9GYY9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
V9GYY9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYY9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
V9GYY9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
V9GYY9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYY9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
V9GYY9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
V9GYY9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
V9GYY9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
V9GYY9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
V9GYY9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
V9GYY9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
V9GYY9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GYY9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GYY9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GYY9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V9GYY9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V9GYY9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V9GYY9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V9GYY9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
V9GYY9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
V9GYY9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
V9GYY9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
V9GYY9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
V9GYY9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
V9GYY9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V9GYY9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V9GYY9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V9GYY9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V9GYY9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V9GYY9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V9GYY9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V9GYY9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V9GYY9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V9GYY9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V9GYY9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
V9GYY9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V9GYY9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
V9GYY9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V9GYY9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYY9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYY9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V9GYY9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYY9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYY9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYY9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V9GYY9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
V9GYY9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYY9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYY9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYY9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
V9GYY9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GYY9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
V9GYY9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
V9GYY9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
V9GYY9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
V9GYY9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms