Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.582e-25■■■■■ 382.3
DGCR8Q8WYQ5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 381.1
DGCR8Q8WYQ5 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.91□□□□□ -0.183e-31■■■■■ 378.9
DGCR8Q8WYQ5 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.223e-31■■■■■ 378.9
DGCR8Q8WYQ5 USMG5-202ENST00000337003 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.573e-31■■■■■ 378.9
DGCR8Q8WYQ5 USMG5-204ENST00000369815 626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.793e-31■■■■■ 378.9
DGCR8Q8WYQ5 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.433e-31■■■■■ 378.9
DGCR8Q8WYQ5 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.523e-31■■■■■ 378.9
DGCR8Q8WYQ5 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.229e-27■■■■■ 370
DGCR8Q8WYQ5 MIR1306-201ENST00000408439 85 ntBASIC7.9□□□□□ -1.144e-88■■■■■ 368.3
DGCR8Q8WYQ5 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.412e-19■■■■■ 365.9
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-214ENST00000585881 582 ntTSL 33.24□□□□□ -1.892e-9■■■■■ 363.5
DGCR8Q8WYQ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.154e-20■■■■■ 361.1
DGCR8Q8WYQ5 MIR210HG-202ENST00000528245 659 ntTSL 314.52□□□□□ -0.094e-20■■■■■ 361.1
DGCR8Q8WYQ5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.094e-20■■■■■ 361.1
DGCR8Q8WYQ5 MIR210HG-204ENST00000534540 367 ntTSL 213.24□□□□□ -0.294e-20■■■■■ 361.1
DGCR8Q8WYQ5 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.798e-13■■■■■ 355.3
DGCR8Q8WYQ5 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.781e-31■■■■■ 351.7
DGCR8Q8WYQ5 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.21□□□□□ -2.067e-49■■■■■ 349
DGCR8Q8WYQ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.159e-49■■■■■ 346.7
DGCR8Q8WYQ5 RNF130-204ENST00000520911 1790 ntTSL 1 (best)28.11■■■□□ 2.099e-49■■■■■ 346.7
DGCR8Q8WYQ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.039e-49■■■■■ 346.7
DGCR8Q8WYQ5 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.449e-49■■■■■ 346.7
DGCR8Q8WYQ5 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.259e-49■■■■■ 346.7
DGCR8Q8WYQ5 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 342
DGCR8Q8WYQ5 HSPA9-213ENST00000524109 1175 ntTSL 59.1□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 342
DGCR8Q8WYQ5 HSPA9-211ENST00000512328 482 ntTSL 34.99□□□□□ -1.612e-8■■■■■ 342
DGCR8Q8WYQ5 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 32.45□□□□□ -2.022e-8■■■■■ 342
DGCR8Q8WYQ5 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 520.36■□□□□ 0.851e-22■■■■■ 333.1
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-206ENST00000540900 2057 ntTSL 515.08■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-211ENST00000584154 583 ntTSL 311.09□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-201ENST00000247026 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-210ENST00000583301 684 ntTSL 310.24□□□□□ -0.771e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-202ENST00000394826 1800 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.941e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.211e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-207ENST00000577289 562 ntTSL 57.34□□□□□ -1.231e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.291e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-212ENST00000584317 564 ntTSL 55.71□□□□□ -1.51e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 NSRP1-204ENST00000475652 1242 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.791e-9■■■■■ 331
DGCR8Q8WYQ5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.591e-22■■■■■ 327
DGCR8Q8WYQ5 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.011e-59■■■■■ 324.8
DGCR8Q8WYQ5 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.155e-21■■■■■ 314.7
DGCR8Q8WYQ5 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.723e-25■■■■■ 314.3
DGCR8Q8WYQ5 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.17e-76■■■■■ 314
DGCR8Q8WYQ5 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.22e-78■■■■■ 310.3
DGCR8Q8WYQ5 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.525e-14■■■■■ 304.1
DGCR8Q8WYQ5 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.672e-43■■■■■ 303.9
DGCR8Q8WYQ5 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.442e-24■■■■■ 302.6
DGCR8Q8WYQ5 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.52e-40■■■■■ 298.6
DGCR8Q8WYQ5 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC13.05□□□□□ -0.325e-22■■■■■ 295.7
DGCR8Q8WYQ5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.43□□□□□ -0.12e-13■■■■■ 289.7
DGCR8Q8WYQ5 MEST-212ENST00000458161 531 ntTSL 57.04□□□□□ -1.282e-8■■■■■ 288.6
DGCR8Q8WYQ5 MEST-210ENST00000437637 555 ntTSL 47□□□□□ -1.292e-8■■■■■ 288.6
DGCR8Q8WYQ5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.953e-17■■■■■ 286
DGCR8Q8WYQ5 ATP11C-209ENST00000485626 643 ntTSL 52.23□□□□□ -2.053e-17■■■■■ 286
DGCR8Q8WYQ5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.071e-22■■■■■ 285.2
DGCR8Q8WYQ5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.941e-22■■■■■ 285.2
DGCR8Q8WYQ5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.611e-22■■■■■ 285.2
DGCR8Q8WYQ5 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.476e-60■■■■■ 282.8
DGCR8Q8WYQ5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.291e-20■■■■■ 280.6
DGCR8Q8WYQ5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC12.88□□□□□ -0.351e-20■■■■■ 280.6
DGCR8Q8WYQ5 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC5.79□□□□□ -1.489e-62■■■■■ 277
DGCR8Q8WYQ5 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1□□□□□ -2.253e-15■■■■■ 275
DGCR8Q8WYQ5 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.67e-25■■■■■ 270.8
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)22.31■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 219.76■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 218.93■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 58.84□□□□□ -0.991e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 38.84□□□□□ -0.991e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.71□□□□□ -1.021e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 42.52□□□□□ -2.011e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 51.03□□□□□ -2.241e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 50.63□□□□□ -2.311e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.732e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MEST-207ENST00000421001 794 ntTSL 518.76■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MEST-208ENST00000427521 882 ntTSL 517.14■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MEST-209ENST00000433159 582 ntTSL 313.88□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MEST-205ENST00000399874 390 ntTSL 310.52□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MEST-203ENST00000378576 2180 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 268.2
DGCR8Q8WYQ5 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.063e-40■■■■■ 265.5
DGCR8Q8WYQ5 CTDSP2-205ENST00000549039 797 ntTSL 210.68□□□□□ -0.71e-10■■■■■ 258.2
DGCR8Q8WYQ5 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.79□□□□□ -1.85e-26■■■■■ 255.2
DGCR8Q8WYQ5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.156e-298■■■■■ 250.6
DGCR8Q8WYQ5 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC7.28□□□□□ -1.247e-29■■■■■ 248.7
DGCR8Q8WYQ5 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.482e-55■■■■■ 247.8
DGCR8Q8WYQ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.971e-8■■■■■ 246.6
DGCR8Q8WYQ5 MIR100HG-223ENST00000636654 1434 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.418e-11■■■■■ 245.9
DGCR8Q8WYQ5 MIR100HG-216ENST00000532319 950 ntTSL 411□□□□□ -0.658e-11■■■■■ 245.9
DGCR8Q8WYQ5 MIR100HG-201ENST00000524376 2684 ntTSL 1 (best)9.79□□□□□ -0.848e-11■■■■■ 245.9
DGCR8Q8WYQ5 MIR100HG-205ENST00000528986 3287 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.168e-11■■■■■ 245.9
DGCR8Q8WYQ5 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.061e-22■■■■■ 237.4
Retrieved 100 of 22,183 protein–RNA pairs in 432.4 ms